Cedar Key er en kommune i Levy County, Florida, USA. Ved folketellingen i 2020 hadde den 687 innbyggere.
Cedar Key består av en gruppe øyer som ligger like utenfor fastlandet. Mye av byens utvikling har skjedd på Way Key siden slutten av 1800-tallet. Navnet «Cedar Key» kommer fra den østlige røde sedertreet Juniperus Virginiana, som en gang var rikelig i området.
Cedar Key har betydelig historisk betydning i delstaten Florida, med en historie som går tilbake til cirka 1000 f.Kr., da regionen var bebodd av førkolumbianske folk.
Denne historiske betydningen ble offisielt anerkjent av den føderale regjeringen 3. oktober 1989, da cirka 32 km² med land i og rundt byen ble lagt til i National Register of Historic Places som Cedar Keys Historic and Archaeological District.
Cedar Key Museum State Park gir innsikt i byens historie fra 1800-tallet og viser en samling skjell og indianerartefakter fra St. Clair Whitman.
Besøkende kan ta en omvisning i det restaurerte Whitman-hjemmet fra 1920-tallet i museets åpningstider. Som dokumentert av byggingen av museet, ble bygningen designet for å tåle de periodiske orkanene som treffer byen.