Hamilton Harbour er en naturlig havn på Bermuda som fungerer som en havn for hovedstaden Hamilton.
Denne havnen er en bukt innenfor Big Sound, og danner en smal vannkorridor mellom Paget County og halvøya der Bermuda’s hovedstad ligger.
Havneadgangen er godt beskyttet av en rekke øyer, inkludert Hinson, Marshall, Long og Hawkins, samt Salt Kettle Peninsula.
Det er en annen øy innenfor havnen kjent som White’s Island.
I den østlige enden av havnen er det en liten bukt omgitt av mangroveskoger, som brukes til å forankre små fritidsfartøy.
Navnet Hamilton Harbour kommer fra byen Hamilton, som ble oppkalt etter guvernøren av Bermuda ved grunnleggelsen i 1793, Sir Henry Hamilton.
Denne havnen var tidligere kjent som Paget Port, oppkalt etter Paget parish i sør. Navnet på sognet ble igjen gitt til ære for William Paget, 4. Baron Paget de Beaudesert.